DSpace Coleção:https://hdl.handle.net/ripcmb/301352026-04-01T10:00:14Z2026-04-01T10:00:14ZAnálise de qualidade de serviço em redes por meio de detecção de pontos de mudança e clusterização baseada em sobrevivência.Gomes, Ian José Agrahttps://hdl.handle.net/20.500.14867/8482432026-03-09T14:58:27Z2025-01-01T00:00:00ZTítulo: Análise de qualidade de serviço em redes por meio de detecção de pontos de mudança e clusterização baseada em sobrevivência.
Autor(es): Gomes, Ian José Agra
Descrição: O objetivo principal deste trabalho é desenvolver e validar uma metodologia robusta
para a análise de qualidade de serviço em redes de computadores, integrando técnicas
de detecção de pontos de mudança, análise de sobrevivência e interpretação assistida
por modelos de linguagem.
Tipo: masterThesis2025-01-01T00:00:00ZInvestigação da produção de agarases por bactérias associadas a macroalgas marinhas do litoral fluminenseAlvarez, Marcelo Torreshttps://hdl.handle.net/20.500.14867/8480502026-01-29T17:39:47Z2025-01-01T00:00:00ZTítulo: Investigação da produção de agarases por bactérias associadas a macroalgas marinhas do litoral fluminense
Autor(es): Alvarez, Marcelo Torres
Abstract: Marine macroalgae are highly diversified photosynthetic organisms capable of
producing high-value metabolites, which can be used as components in various
biotechnological products essential for modern life. Marine macroalgae have
ecological relationships with various living beings, including microorganisms, such as
bacteria that produce specific enzymes, particularly carbohydrate-active enzymes
(CAZymes). Among these CAZymes, agarases stand out, capable of hydrolyzing the
agar polysaccharide present in the cell wall of algae of the phylum Rhodophyta. In this
context, the prospecting of agarase-producing microorganisms is essential for the
discovery of new industrial biocatalysts, especially given the multiplicity of applications
of agarolytic enzymes and biologically active oligosaccharides derived from their
action. This study aims to isolate and investigate the diversity of agarase-producing
bacteria in macroalgae collected in different cities on the coast of Rio de Janeiro. A
total of 26 marine macroalgae specimens covering the genera Ulva (Chlorophyta),
Sargassum (Phaeophyceae), Laurencia (Rhodophyceae), and Codium (Chlorophyta)
were collected in 6 expeditions: 2 in Enseada do Bananal (Niterói, RJ); 1 in Praia de
Boa Viagem (Niterói, RJ); 1 in Praia da Urca (Rio de Janeiro, RJ); 2 in Praia Rasa
(Armação dos Búzios, RJ). A total of 583 bacteria were isolated in various media,
including Marine, Marine 1:10, MMM, MMM + agarose, MMM + alginate, casein starch
agar, MMM + oil, and LB. After screening for agarase production in Hu medium, 286
of the 583 bacteria (49.05%) showed agarolytic activity. A total of 125 of 273 potentially
agarolytic bacteria (45.79%) tested exhibited activity in catabolic profile tests in MMM
added with agarose to evaluate the consumption of this polysaccharide form as the
sole carbon source. Additionally, the identification of truly agarolytic bacteria, capable
of generating depression and/or liquefaction of agar and/or agarose during growth in
isolation media and screening media, was performed. During isolation, 15 strains were
identified as truly agarolytic, but only 8 obtained positive results in enzymatic activity
stages, of which 2 also generated depression in the MMM+agarose stage and 1
generated depression in Hu medium. Notably, all these samples were isolated from
macroalgae collected in Praia Rasa (Armação dos Búzios), mostly from the genus
Codium. After submission for identification by MALDI-TOF mass spectrometry, a total
of 309 of 437 samples were classified with reliability at the genus level, with Vibrio
being the most predominant genus, with 215 strains (69.8%). Based on the results
obtained, the selected stages in the study highlight a promising source of tracking for
agarolytic bacteria.
Descrição: As macroalgas marinhas são organismos fotossintetizantes altamente diversificados,
capazes de produzir metabólitos de alto valor agregado, os quais podem ser utilizados
como componentes em diversos produtos biotecnológicos essenciais para a vida
moderna. As macroalgas marinhas possuem relações ecológicas com diversos seres
vivos, dentre eles os micro-organismos, incluindo bactérias produtoras de enzimas
específicas, particularmente as enzimas ativas em carboidratos (CAZymes). Dentre
essas CAZymes, destacam-se as agarases, capazes de hidrolisar o polissacarídeo
ágar presente na parede celular de algas do filo Rhodophyta. Nesse contexto, a
prospecção de microrganismos produtores de agarases se faz essencial para
descoberta de novos biocatalisadores industriais, especialmente diante da
multiplicidade de aplicações de enzimas agarolíticas e os oligossacarídeos
biologicamente ativos derivados de sua ação. Este estudo tem como objetivo isolar e
investigar a diversidade de bactérias produtoras de agarases em macroalgas
coletadas em diferentes cidades do do litoral fluminense. Um total de 26 espécimes
de macroalgas marinhos abrangendo os gêneros Ulva (Chlorophyta), Sargassum
(Phaeophyceae), Laurencia (Rhodophyceae) e Codium (Chlorophyta) foram coletadas
em 6 expedições: 2 na Enseada do Bananal (Niterói, RJ); 1 na Praia de Boa Viagem
(Niterói, RJ); 1 Praia da Urca (Rio de Janeiro, RJ); 2 Praia Rasa (Armação dos Búzios,
RJ). Uma soma de 583 bactérias foram isoladas nos meios Marine, Marine 1:10,
MMM, MMM + agarose, MMM + alginato, ágar amido caseína, MMM + óleo e LB. Após
triagem da produção dessas enzimas em meio de Hu, um conjunto de 286 das 583
bactérias (49,05%) apresentaram atividade agarolítica. Um total de 125 de 273
bactérias potencialmente agarolíticas (45,79%) testadas exibiram atividade em testes
de perfil catabólico em MMM adicionado de agarose para avaliação do consumo dessa
forma do polissacarídeo como única fonte de carbono. Complementarmente foi
realizado a identificação de bactérias verdadeiramente agarolíticas, capazes de gerar
depressão e/ou liquefação do ágar e/ou agarose durante o crescimento nos meios de
isolamento e nos meios adotados nessa etapa de triagem. Durante o isolamento foram
identificadas 15 estirpes consideradas verdadeiramente agarolítca, entretanto,
apenas 8 obtiveram resultado positivo nas etapas de atividade enzimática, das quais
2 também geraram depressão na etapa de MMM+agarose e 1 gerou depressão em
meio de Hu. Em particular, todas essas amostras foram isoladas das macroalgas
coletadas em Praia Rasa (Armação dos Búzios), majoritariamente do gênero Codium.
Após envio para identificação por espectrometria de massas MALDI-TOF, uma soma
de 309 de 437 amostras foram classificadas com confiabilidade a nível de gênero,
sendo o gênero mais predominante de Vibrio, com 215 estirpes (69,8%). Com base
nos resultados obtidos, as etapas selecionadas no estudo notabilizam uma promissora
fonte de rastreamento para bactérias agarolíticas.
Tipo: masterThesis2025-01-01T00:00:00ZFerramenta interativa e colaborativa: um agregador sobre espécies marinhas, www.especies.infoTravassos, Ludmila Rodrigueshttps://hdl.handle.net/20.500.14867/8480452026-01-29T13:14:43Z2025-01-01T00:00:00ZTítulo: Ferramenta interativa e colaborativa: um agregador sobre espécies marinhas, www.especies.info
Autor(es): Travassos, Ludmila Rodrigues
Abstract: The increasing complexity of environmental data and the dispersion of
information pose significant challenges to marine biodiversity conservation. This study
identified opportunities to optimize the collection, integration, and analysis of
environmental data. Aiming to improve marine monitoring, the main objective was to
develop an interactive and collaborative tool to integrate dispersed information, with a
focus on monitoring marine species, particularly invasive ones. Specifically, we aimed
to: (1) Develop a digital tool that enables the recording of occurrences with data
storage, including mechanisms for monitoring exotic, invasive, or threatened marine
species, while facilitating public engagement in species reporting. (2) Structure a
georeferenced occurrence database of monitored species, establishing levels of
information reliability. (3) Define a general workflow of participants and their
contributions. A tool was developed that allows systematic georeferenced data
collection, with expert validation, user interaction, and access control, designed to
meet the needs of managers, researchers, and citizens. This promotes increased
collaboration and improves the quality of information about species. The development
of data validation protocols by experts enhanced the reliability of the information and
contributed to more effective environmental management and control strategies. This
study aims to contribute to the integration of dispersed environmental data and to foster
collaboration among diverse stakeholders to address the challenges of marine
conservation. The developed tool (www.especies.info) has demonstrated strong
potential to enable data collection activities and foster the creation of a collaborative
network, supporting the fight against bioinvasion and the management of marine
biodiversity.
Descrição: A crescente complexidade dos dados ambientais e a dispersão das
informações representam desafios significativos para a conservação da
biodiversidade marinha. Este estudo identificou possibilidades para otimizar a coleta,
integração e análise de dados ambientais. Visando a melhoria do monitoramento
marinho, buscamos como objetivo principal, construir uma ferramenta interativa e
colaborativa para integrar informações dispersas, com foco no monitoramento de
espécies marinhas, especialmente as invasoras. Especificamente, buscamos: (1)
Construir uma ferramenta digital que viabilize o registro de ocorrências com o
armazenamento de dados, desenvolvendo mecanismos para o monitoramento de
espécies marinhas exóticas, invasoras ou ameaçadas facilitando o engajamento da
sociedade no registro de ocorrências de espécies. (02) Estruturar um banco de dados
de registros de ocorrências georreferenciado das espécies monitoradas
estabelecendo níveis de confiabilidade das informações. (03) Definir um fluxograma
de funcionamento geral de participantes e suas contribuições. Foi desenvolvida uma
ferramenta que permite a coleta de dados sistemática georreferenciados, com a
validação por especialistas em interação entre usuários diversos com controle de
acesso, de modo a atender às necessidades de gestores, pesquisadores e cidadãos,
promovendo a ampliação da colaboração e a qualificação das informações sobre as
espécies. O desenvolvimento de protocolos de validação de dados por especialistas
aumentou a confiabilidade das informações e contribuiu para estratégias mais
eficazes de manejo e controle ambiental. Este estudo busca contribuir para a
integração de dados ambientais dispersos e promoção da colaboração entre diversos
atores para enfrentar os desafios da conservação marinha. A ferramenta construída
(www.especies.info) demonstrou um potencial de viabilizar atividades de coleta de
dados e de promover a criação de uma rede colaborativa auxiliando no combate à
bioinvasão e na gestão da biodiversidade marinha.
Tipo: masterThesis2025-01-01T00:00:00ZAtenuação acústica em duas regiões distintas da Plataforma Continental do Sudeste BrasileiroAnjos, Yasmin Cristina Bidú doshttps://hdl.handle.net/20.500.14867/8480442026-01-28T13:33:38Z2024-01-01T00:00:00ZTítulo: Atenuação acústica em duas regiões distintas da Plataforma Continental do Sudeste Brasileiro
Autor(es): Anjos, Yasmin Cristina Bidú dos
Abstract: This study assessed the acoustic attenuation in high-productivity regions of
the southeastern Brazilian continental shelf, specifically examining how zooplank-
ton biomass influences sound propagation. The research was conducted in two
areas with contrasting oceanographic regimes: Arraial do Cabo/RJ, known for its
upwelling system, and Sepetiba/RJ, characterized by more stable coastal waters.
Oceanographic and biological data were collected during two Tactical System of
Environmental Factors (STFA) project campaigns. The findings indicated that
although zooplankton–induced acoustic attenuation was generally low, it varied
significantly depending on the size fractions of the zooplankton and the sound fre-
quencies analyzed. Larger zooplankton contributed more to attenuation at lower
frequencies, while microzooplankton had a more pronounced impact at higher fre-
quencies. Fluorescence was identified as a valuable tool for estimating zooplankton
concentration and distribution, offering insights into how these organisms influence
acoustic propagation. Future research should focus on exploring additional oceanic
regions and bearing a broader range of biological and physical factors that may affect
sound transmission in the marine environment.
Descrição: Este estudo teve como objetivo avaliar a atenuação acústica em regiões de alta
produtividade na plataforma continental sudeste do Brasil, com foco na influência da
biomassa zooplanctônica sobre a propagação do som. A pesquisa foi conduzida em
duas áreas com regimes oceanográficos distintos: Arraial do Cabo-RJ e Sepetiba-RJ.
Dados oceanográficos físicos e biológicos foram coletados durante duas campanhas
no âmbito do projeto Sistema Tático de Fatores Ambientais (STFA). Os resultados
mostraram que a atenuação acústica causada pelo zooplâncton é baixa, mas varia
conforme as frações de tamanho (macro, meso e micro) e as frequências de som
analisadas. Em Arraial do Cabo, a maior biomassa de zooplâncton, especialmente
macrozooplâncton, resultou em uma atenuação mais expressiva. Já em Sepetiba, a
atenuação foi menos pronunciada devido às variações de temperatura e salinidade. A
fluorescência se mostrou uma ferramenta promissora para estimar a concentração e a
distribuição do zooplâncton, possibilitando uma melhor compreensão da atenuação
acústica causada por esses organismos. O estudo sugere que para baixas frequências,
como as emitidas por submarinos e navios, a influência do zooplâncton na atenuação
é negligenciável. Para estudos futuros, recomenda-se a exploração de outras regiões
oceânicas e a análise de fatores adicionais que possam influenciar a propagação do
som no ambiente marinho, como a interação entre zooplâncton e o sedimento em
suspensão.
Tipo: masterThesis2024-01-01T00:00:00Z